Caracterização molecular das regiões genômicas hbz e LTR do HTLV-1 em pacientes com diferentes manifestações clínicas

Abstract

O Vírus Linfotrópico de Células T Humanas do tipo 1 (HTLV-1) afeta cerca de 5 a 10 milhões de pessoas no mundo, que podem se manter assintomáticas (AC) ou evoluírem para doenças inflamatórias e/ou patologias severas, como paraparesia espástica tropical/mielopatia associada ao HTLV-1 (HAM/TSP). O genoma viral é flanqueado por regiões LTR e contém genes estruturais, genes responsáveis pelas enzimas virais e uma região pX que codifica proteínas acessórias e regulatórias, a exemplo de Tax, p12 e HBZ. O objetivo deste estudo é descrever a caracterização molecular das regiões de hbz e LTR a partir de amostras de pacientes infectados pelo HTLV-1. Foram selecionadas 15 amostras de pacientes AC e HAM/TSP do CHTLV da Escola Bahiana de Medicina e Saúde Pública. Foi realizada PCR de todas as amostras, os produtos foram checados através de gel de agarose e, os que amplificaram pelo menos uma região de interesse, foram purificados e sequenciados (Sanger). Além disso, foram selecionadas 571 sequências de hbz e 151 de LTR publicadas nos bancos de dados Genbank e HTLV-1 Molecular Epidemiology Database. O programa Geneious Prime, foi utilizado para alinhamento, identificação das mutações nas duas regiões de interesse e mapeamento de sítios de transcrição (TFBS) de LTR. Para a região de hbz, o perfil físico-químico das sequências e sítios de modificação pós-traducionais foram analisados. A genotipagem das sequências foi definida através de árvore filogenética, usando a região LTR. Neste artigo, são descritas duas mutações não-sinônimas de HBZ, V17M e R121Q, encontradas em frequências diferentes nas sequências de AC e HAM/TSP quando comparados. Essas mutações alteraram propriedades físico-químicas e podem ter um papel no estabelecimento da sintomatologia. Dentre os TFBS descritos, alterações nos sítios Sp1 foram encontrados tanto no CHTLV quanto nos bancos de dados e podem ser importantes na expressão de HBZ. Este trabalho identifica possíveis fatores de diferenciação das manifestações clínicas entre diferentes pacientes infectados por HTLV-1, como as mutações V17M e R121Q e a exclusão de TFBS por conta de mutações, a exemplo da G418A.