Uso de sequenciamento de nova geração baseado em nanoporos para manejo de surtos epidêmicos causados por arbovírus

Abstract

As técnicas de sequenciamento de nova geração têm se constituído uma ferramenta muito útil para a identificação, estudos da diversidade e da dispersão de arbovírus no mundo. Nos tempos recentes, diversos estudos utilizaram o sequenciamento baseado na tecnologia de nanoporos para o manejo de surtos virais. Essa revisão aborda as metodologias de sequenciamento de terceira geração que utilizam de nanoporos para investigação de surtos causados por arbovírus. Para tanto, foi realizada a busca de artigos publicados em bases indexadas que envolveram o uso de sequenciamento por nanoporos, no período de 2014 a 2019 onde foram selecionados, por critérios de inclusão e exclusão estabelecidos, 13 artigos originais. Os estudos analisados mostraram que o MinION se tornou uma ferramenta muito útil para o sequenciamento genômico, principalmente em regiões com infraestrutura reduzida. Todavia, após análise das discussões, pode-se notar que o MinION ainda possui taxas de erro e falhas que poderiam ser cobertas se fossem empregadas outras técnicas de sequenciamento que não se utilizam de nanoporos.