Caracterização molecular do gene tax do HTLV-1 de sequências de indivíduos com diferentes formas clínicas

Abstract

O Vírus Linfotrópico de Células T Humanas do tipo 1 (HTLV-1) afeta de 5 a 10 milhões de indivíduos mundialmente. A infecção pode ser assintomática ou levar ao desenvolvimento de doenças associadas, como a Paraparesia Espástica Tropical/Mielopatia Associada ao HTLV 1 (HAM/TSP) e o Linfoma de Células T do Adulto (ATL). A ação da proteína Tax é essencial na patogênese dessas doenças. O objetivo deste estudo é avaliar as variações genéticas no gene Tax do HTLV-1 em sequências disponíveis em base de dados e estabelecer possíveis relações entre as mutações e o desenvolvimento de doenças associadas ao HTLV-1. Os bancos de dados GenBank e HTLV-1 Molecular Epidemiology Database foram utilizados para a identificação das sequências incluídas. Os programas MAFFT e AliView foram utilizados para alinhamento com a sequência referência, seleção da região genômica de interesse e identificação das mutações. O efeito das mutações nas propriedades físico-químicas da proteína e nos sítios de modificações pós traducionais foram analisados na plataforma PRABI e as análises estatísticas realizadas no GraphPad Prism. Foram incluídas 336 sequências e quatro mutações não sinônimas foram identificadas numa frequência entre 5 e 95% das sequências: M107V, I170V, A219V e N230H. A mutação A219V foi mais frequente em pacientes com HAM/TSP com suporte estatístico e alterou propriedades físico-químicas da proteína. As outras mutações não apresentaram associação com perfil clínico, mas alteraram propriedades físico-químicas da proteína. A mutação A219V pode estar relacionada ao desenvolvimento de HAM/TSP, contudo são necessárias outras análises, como análises funcionais, e correlações adicionais com outros fatores.